故事讲述两派来到地球后，因为发生了一些“事件”，导致双方外形大变（也解释了两系列风格不同的原因）。也由于这些“事件”，变形金刚要隐藏于人类社会之中。如何去平衡一切关系是擎天柱作为领袖将要面临的考验，本作品的标题也由此而来。 值得一提的是，本次两派领袖 擎天柱 和 威震天 的配音者是久违的梦幻组合：来自初代动画的 Peter Cullen jijidy.com 和 Frank Welker！他们在阔别电视版的变形金刚作品多年后，再次一起回来共演这双经典的死对头！
邪恶的奈落与犬夜叉一行的战争愈演愈烈，为了保护心脏不受伤害，他在白灵山分离出一个能洞察人类心灵的婴儿，并将心脏托其保管。在此之后，婴儿被某高僧砍作两半，变成白童子和赤子。当得知奈落心脏的重要性时，这两个同样邪恶的童子决定反客为主。赤子利用魍魉丸不断加固体外的甲胄，白童子 和神乐则在与犬夜叉战斗的同时暗中与奈落展开对抗。老奸巨滑的奈落利用犬夜叉等人之手除掉白童子，并杀害神乐。犬夜叉、钢牙、杀生丸为了除掉奈落也不断提高各自的战斗力，双方的抗争终于接近高潮，宿命中的正邪决战在所难免…… 2004年，由高桥留美子人气漫画《犬夜叉》改编的同名动画因赶上原著连载的进度无以为继，被迫中断。2008年《犬夜叉》漫画连载完毕，中断五年的TV动画版也再次启动，并命名为《犬夜叉 完结篇》。
